午前に検査を受けられる場合は、検査前日の夜9時以降は絶食してください（夕食は軽めにしてください）。
午後の検査の場合は、当日の朝7時までに、パンやうどん、栄養ゼリーなど軽めの朝食をとっていただいて大丈夫です（ご飯、野菜は不可）。その後、水分は摂って頂いて結構です。

血圧、心臓の薬を常用している方は、検査予定の2時間前までに飲んでください。その他の薬に関しては飲まないでください。特に糖尿病の薬は飲まないでください。インスリンも打たないでください。不明な点がございましたら、ご相談ください。

血液をさらさらにする薬（抗凝固薬のワーファリンなどや、抗血小板薬のアスピリンなど）は生検（組織を採取して顕微鏡で見る検査）の際に血がとまりにくくなる危険があるため、これらの薬を内服中の方は事前にお申し出ください（内服を一時的にストップしていただく場合もあります）。

来院後、胃の中をきれいにする薬を飲んでいただきます。その後、鼻腔の麻酔を行なった後、内視鏡検査をはじめます。検査は5～10分ほどで終了します。

鼻腔が狭く内視鏡挿入が困難な場合は、経口挿入に変更となる場合があります。

検査終了後、結果説明を医師より行います。必要あらば薬の処方を行います。生検を施行した場合は、その結果説明のために1～2週間あけて来院していただきます。

まれに検査の影響で鼻出血を起こす可能がありますが、内視鏡検査終了後に鼻を押さえることで止血することができます。
また、出血の原因となりますので、検査後に鼻を強くかまないようにしてください。

検査後1時間程度は、喉への麻酔効果が残っています。それまでは誤飲する可能性がありますので注意してください。

検査の時に入れた空気の影響で、軽い腹痛や不快感がしばらく続くことがあります。強い腹痛、吐血、タール便（こげたような真っ黒い便）が出現した場合はご連絡ください。

検査後1時間以上経過して腹痛がなければ、食事や水分を摂ってもらって結構です。なお、当日は消化の良いものを食べ、刺激物、飲酒、運動は控えてください。